279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3681 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
299 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  51.02 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  46.51 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  47.51 
 
 
299 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.62 
 
 
297 aa  244  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1935  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  47 
 
 
314 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7307  gluconolactonase  44.11 
 
 
296 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2119  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.61 
 
 
313 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1002  gluconolactonase  42.9 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.968927  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6822  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.75 
 
 
276 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  40.34 
 
 
296 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1822  gluconolactonase  38.38 
 
 
302 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  38.91 
 
 
283 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  38.91 
 
 
283 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  38.91 
 
 
283 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2345  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.87 
 
 
286 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0169935  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.88 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.06 
 
 
282 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0226  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.33 
 
 
294 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.19 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.19 
 
 
313 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.19 
 
 
313 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 
309 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.8 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  29.18 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  28.18 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  30.39 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.45 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.35 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.66 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.35 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.68 
 
 
334 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 
307 aa  79  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.95 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.95 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  30.39 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  30.74 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.24 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.86 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.32 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.13 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.92 
 
 
569 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  28.87 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.62 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.96 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.22 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  29.12 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  24.81 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.02 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  27.41 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  26.21 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  27.08 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.89 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.23 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.64 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.63 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.15 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.15 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.73 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  30.77 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  32.69 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.16 
 
 
581 aa  68.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2637  senescence marker protein-30 family protein  30.39 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.13 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  31.32 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  32.84 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  32.84 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.87 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.3 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  23.67 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  23.67 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  32.34 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.25 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.81 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.9 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  25.65 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.17 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  27.19 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  30 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  29.66 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  27.91 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.43 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  29.66 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.27 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3342  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.67 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  29.66 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.47 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  29.1 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  29.66 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.04 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  27.3 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4224  gluconolactonase  34.3 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.09 
 
 
307 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  29.83 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0235  gluconolactonase  32.58 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  26.99 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  30.07 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  28.67 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2370  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.28 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  0.816592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>