273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6274 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  100 
 
 
308 aa  621  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  81.23 
 
 
309 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  80.91 
 
 
309 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  81.23 
 
 
309 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.79 
 
 
307 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.6 
 
 
305 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.42 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.98 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  50.99 
 
 
303 aa  301  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  49.34 
 
 
323 aa  291  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  49.84 
 
 
306 aa  281  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  44.7 
 
 
286 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2741  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.86 
 
 
290 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.25 
 
 
306 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.93 
 
 
306 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.14 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.18 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.03 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.32 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.63 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  26.96 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.17 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.17 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.18 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.67 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  29.05 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.59 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.59 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.77 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.77 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.58 
 
 
334 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.03 
 
 
304 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  29.1 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  27.42 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.47 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.42 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  27.61 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.08 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  27.61 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.35 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  26.13 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  26.58 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1102  gluconolactonase, putative  38.76 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  27 
 
 
281 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  27.87 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.9 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  24.27 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.98 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  28.4 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0186  gluconolactonase  27.19 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.21 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  35.33 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.21 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  26.88 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0479  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.78 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.35 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  25.96 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  23.41 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  24.5 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.44 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  24.74 
 
 
533 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.96 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  23.62 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  23.34 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  22.53 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  22.56 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  23.32 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.9 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  23.1 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  23.99 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  25 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.36 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  33.72 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  26.72 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.44 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.77 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3138  gluconolactonase  28.71 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  24.74 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.13 
 
 
569 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  23.3 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3876  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.71 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  22.98 
 
 
353 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.74 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  25.35 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  25.08 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  22.95 
 
 
304 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  30.67 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  22.37 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.58 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.27 
 
 
581 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  33.08 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  23.31 
 
 
328 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  23.43 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.51 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  27.72 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.51 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  23.43 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>