More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0871 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
296 aa  615  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.86 
 
 
305 aa  328  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  49.32 
 
 
303 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.36 
 
 
295 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  47.93 
 
 
292 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  41.16 
 
 
297 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.24 
 
 
307 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.63 
 
 
307 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.74 
 
 
304 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.69 
 
 
307 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.87 
 
 
298 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.87 
 
 
298 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  26.37 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.15 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.74 
 
 
307 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.71 
 
 
302 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.95 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.98 
 
 
533 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  30.36 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  27.73 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  36.36 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.62 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  26.89 
 
 
323 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.69 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.17 
 
 
581 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.91 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.05 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.35 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.35 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  27.51 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.85 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.85 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  28.63 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  26.91 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  27.04 
 
 
362 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  27 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.28 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  27.8 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.37 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.15 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  30.26 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  27.35 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.14 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.14 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  31.64 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.14 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  26.09 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.66 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.05 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  24.14 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  28.9 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.88 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  26.77 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  21.84 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  25.28 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.19 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  27.89 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.46 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.82 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.81 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  25.88 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  21.84 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.71 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  28.57 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.75 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.84 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.44 
 
 
579 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  28.26 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  33.81 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.74 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  23.76 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  29.89 
 
 
545 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  32.84 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  22.91 
 
 
546 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1696  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.49 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  28.8 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.59 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  24.71 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.32 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  26.41 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  24.54 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  24.54 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  26.69 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.4 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.5 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  27.69 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.91 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.23 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02380  conserved hypothetical protein  37.69 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.67 
 
 
569 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.56 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  27.89 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  26.04 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.58 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3700  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  26.04 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  29.14 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  27.22 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  29.14 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>