174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0864 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  100 
 
 
286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.16 
 
 
305 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  47.23 
 
 
306 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  47.19 
 
 
303 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  44.88 
 
 
309 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  44.88 
 
 
309 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.55 
 
 
309 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  44.7 
 
 
308 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.04 
 
 
303 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  42.72 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.01 
 
 
317 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.26 
 
 
307 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.36 
 
 
307 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2741  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.03 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1102  gluconolactonase, putative  44.09 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.58 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  28.74 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.43 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.01 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.24 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  27.93 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.15 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 
334 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.4 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.26 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.06 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  26.45 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.06 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  26.81 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  28.27 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.68 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.47 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.47 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  25.77 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.67 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.67 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  26.55 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.33 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  26.48 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  27.94 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.74 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  28.67 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  25.99 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.72 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  27.74 
 
 
340 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.06 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.85 
 
 
339 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  27.67 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  31.16 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.74 
 
 
579 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  26.6 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  25.09 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  28.72 
 
 
363 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  26.96 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  26.03 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.38 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  25.44 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  23.96 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  24.48 
 
 
338 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  25.09 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.95 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  30.73 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 
366 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  27.96 
 
 
328 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  24.48 
 
 
338 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  28.32 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  27.37 
 
 
308 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  25.35 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.98 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.59 
 
 
296 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  27.27 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  27.09 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  25.18 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  28.49 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.3 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.13 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.35 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  32.35 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.84 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  25.37 
 
 
340 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  26.07 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  25.93 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  24.58 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.95 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.11 
 
 
368 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  29.65 
 
 
324 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  20.82 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  28.3 
 
 
545 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  26.06 
 
 
372 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.14 
 
 
581 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  26.03 
 
 
281 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  26.96 
 
 
352 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.91 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.19 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  25.34 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  26.11 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  25.18 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  26.32 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>