258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3295 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
579 aa  1184    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  57.51 
 
 
581 aa  689    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5718  putative esterase  65.29 
 
 
475 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1351  putative esterase  45.98 
 
 
298 aa  226  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50835  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0594  putative esterase  41.64 
 
 
343 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0322  putative esterase  39.62 
 
 
286 aa  163  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0574968  normal  0.0221757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13750  enterochelin esterase-like enzyme  39.06 
 
 
281 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.96 
 
 
334 aa  128  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.6 
 
 
307 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.58 
 
 
306 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.68 
 
 
302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  29.64 
 
 
281 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  29.64 
 
 
287 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  28.28 
 
 
323 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.46 
 
 
307 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  27 
 
 
328 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  26.54 
 
 
325 aa  91.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.92 
 
 
334 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  27.3 
 
 
302 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  30.2 
 
 
296 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  28.74 
 
 
299 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  28 
 
 
308 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  27.12 
 
 
545 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.46 
 
 
303 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.37 
 
 
275 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.39 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.76 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  27.48 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  28.57 
 
 
340 aa  84  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  26.46 
 
 
328 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.79 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.79 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.74 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  26.25 
 
 
296 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  27.54 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  25.24 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.19 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  27.72 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.24 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  29.1 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  29.48 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.39 
 
 
306 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  28.09 
 
 
314 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  26.71 
 
 
308 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  27.54 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  26.64 
 
 
533 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.8 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.8 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  26.02 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  24.3 
 
 
338 aa  77  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  23.97 
 
 
286 aa  77  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  24.3 
 
 
338 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.44 
 
 
296 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.79 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.2 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  26.03 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  34.62 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  24.83 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.53 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  24.83 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  28.51 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  24.5 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  22.19 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.46 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  25.64 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  24.18 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  32.67 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  25.83 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  25.51 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.47 
 
 
298 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.47 
 
 
298 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  26.69 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  28 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  24.91 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  24.23 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  23.26 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  25.08 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  25.64 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  29.32 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.32 
 
 
301 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.42 
 
 
368 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.32 
 
 
301 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  27.37 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.37 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  24.19 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  24.19 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  24.19 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.17 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  25.5 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  24.19 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.03 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5450  putative esterase  29.32 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  25.27 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  25.18 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  24.19 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  24.2 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  25.25 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  26.42 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>