40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5718 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5718  putative esterase  100 
 
 
475 aa  986    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  65.75 
 
 
581 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  66.55 
 
 
579 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0594  putative esterase  40.69 
 
 
343 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1351  putative esterase  44.22 
 
 
298 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50835  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0322  putative esterase  36.63 
 
 
286 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0574968  normal  0.0221757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13750  enterochelin esterase-like enzyme  36.76 
 
 
281 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5450  putative esterase  27.59 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1112  putative esterase  24.79 
 
 
409 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291043  normal  0.610364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 
334 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  24.38 
 
 
526 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  24.38 
 
 
526 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1478  putative esterase  25.31 
 
 
355 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.46 
 
 
306 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1299  putative esterase  27.47 
 
 
322 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.528864  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1594  putative esterase  26.64 
 
 
409 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48746  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  25.69 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3950  putative esterase  22.5 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0114  hypothetical protein  24.34 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  29.84 
 
 
281 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2449  putative esterase  23.79 
 
 
398 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.922476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1004  putative esterase  26.09 
 
 
591 aa  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0016  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.7 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.726882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0939  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  25.77 
 
 
478 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  29.75 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  29.03 
 
 
287 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.56 
 
 
293 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  28.46 
 
 
308 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.77 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  26.58 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  24.78 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0015  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.96 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1492  enterobactin/ferric enterobactin esterase  21.27 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00312601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1136  putative esterase  22.55 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0946  putative esterase  22.65 
 
 
243 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1666  putative esterase  22.88 
 
 
242 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.51 
 
 
302 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  25.21 
 
 
314 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  25.15 
 
 
285 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1349  hypothetical protein  25.9 
 
 
243 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>