271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0257 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  100 
 
 
350 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  81.05 
 
 
352 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  79.31 
 
 
357 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  69.52 
 
 
324 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  63.66 
 
 
353 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  60.46 
 
 
363 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  59.89 
 
 
366 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  60.11 
 
 
368 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  58.69 
 
 
372 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  64.87 
 
 
316 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  64.65 
 
 
312 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  59.59 
 
 
362 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  63.66 
 
 
322 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  61.9 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  60.58 
 
 
313 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  61.22 
 
 
313 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  61.22 
 
 
313 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  61.22 
 
 
316 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  61.22 
 
 
313 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  61.22 
 
 
313 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  56.65 
 
 
332 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  59.62 
 
 
312 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  58.65 
 
 
316 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  50.65 
 
 
296 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  52.58 
 
 
304 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  50.32 
 
 
304 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.53 
 
 
300 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  48.88 
 
 
303 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.69 
 
 
407 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  48.87 
 
 
304 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  48.23 
 
 
303 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  49.04 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  46.95 
 
 
304 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  47.73 
 
 
308 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  47.57 
 
 
306 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  47.73 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  47.87 
 
 
299 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  49.03 
 
 
310 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  43.65 
 
 
304 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  46.43 
 
 
302 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  48.75 
 
 
307 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  48.44 
 
 
302 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  49.11 
 
 
307 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.76 
 
 
415 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.45 
 
 
406 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  90.08 
 
 
197 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  41.74 
 
 
371 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  42.54 
 
 
343 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  40.55 
 
 
327 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  43.22 
 
 
323 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  40.19 
 
 
310 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  42.14 
 
 
328 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  41.51 
 
 
328 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  39.04 
 
 
286 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  42.91 
 
 
281 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  43.4 
 
 
287 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  54.79 
 
 
183 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  54.79 
 
 
183 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.91 
 
 
318 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  39.04 
 
 
281 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  37.88 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  38.4 
 
 
340 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  38.82 
 
 
533 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  38 
 
 
545 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.24 
 
 
342 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  70.49 
 
 
131 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  70.49 
 
 
131 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  34.93 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  36.83 
 
 
338 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  32.17 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  35.62 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  33.88 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  33.75 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  34.06 
 
 
314 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  35.09 
 
 
325 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.72 
 
 
306 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  33.94 
 
 
340 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  37.24 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  32.05 
 
 
338 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.58 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  37.36 
 
 
247 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  29.41 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  27.3 
 
 
398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.48 
 
 
302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.21 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30 
 
 
581 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  31.28 
 
 
353 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.47 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.47 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  30.85 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  30.07 
 
 
294 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  30.48 
 
 
297 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.36 
 
 
298 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.36 
 
 
298 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  30.52 
 
 
477 aa  87  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.04 
 
 
303 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  27.9 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.67 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.43 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>