299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2426 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  100 
 
 		 318 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  60.25 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  57.55 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  48.69 
 
 		 340 aa  309  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  49.19 
 
 		 340 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  40.69 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  42.36 
 
 		 545 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  43.29 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  43.29 
 
 		 287 aa  225  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  42.99 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  35.41 
 
 		 398 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  40.58 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  39.1 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  38.22 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  37.42 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  40.63 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  37.91 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  38.62 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  38.15 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  38.44 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  39.72 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  37.72 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  38.26 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  37.18 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  37.9 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  35.83 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  37.92 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  36.34 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  38.64 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  41.18 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  36.31 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  37.92 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  37.88 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  35.33 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  37.69 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  37.69 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  37.69 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  37.69 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  37.69 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  38.01 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  39.12 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  38.66 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  37.08 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  36.74 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  37.38 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.52 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.55 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  37.88 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.45 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  37.59 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  34.88 
 
 		 533 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  34.77 
 
 		 299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  37.54 
 
 		 281 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  37.76 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.1 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  36.79 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  35.09 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  34.78 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  33.44 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  34.87 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  34.38 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  34.16 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  34.65 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  36.82 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  35.31 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  33.88 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  33.01 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  33.55 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  31.97 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.15 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  32 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  34.56 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  32.51 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.05 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  34.11 
 
 		 247 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  29.46 
 
 		 371 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.52 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.9 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.21 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.56 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  43.17 
 
 		 131 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  43.17 
 
 		 131 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  27.59 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.22 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.22 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  29.45 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.77 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.77 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.31 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.27 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.63 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.95 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  31.37 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.37 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  30.26 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.48 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  32.45 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  32.45 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>