More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5439 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  100 
 
 
316 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  86.22 
 
 
312 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  71.15 
 
 
322 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  70.79 
 
 
315 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  64.87 
 
 
350 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  66.34 
 
 
313 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  66.34 
 
 
313 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  66.34 
 
 
313 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  66.34 
 
 
313 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  66.34 
 
 
316 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  65.47 
 
 
316 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  65.7 
 
 
312 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  66.12 
 
 
313 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  63.72 
 
 
357 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  61.59 
 
 
352 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  62.74 
 
 
324 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  62.66 
 
 
332 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  59.37 
 
 
353 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.79 
 
 
368 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  56.33 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  53.92 
 
 
362 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  56.33 
 
 
363 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  56.33 
 
 
366 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  57.14 
 
 
304 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  58.14 
 
 
304 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  55 
 
 
296 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  55.15 
 
 
303 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  51.64 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  54.64 
 
 
306 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  51.97 
 
 
303 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  52.98 
 
 
304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  52.68 
 
 
299 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  56.03 
 
 
307 aa  295  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  50.5 
 
 
304 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.65 
 
 
310 aa  292  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  49.33 
 
 
300 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  50.17 
 
 
302 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  54.26 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.99 
 
 
407 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  51.42 
 
 
302 aa  275  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  47.33 
 
 
304 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  48.68 
 
 
308 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.67 
 
 
415 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  47.51 
 
 
308 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  44.48 
 
 
371 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.38 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  44.05 
 
 
343 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  42.95 
 
 
310 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  62.5 
 
 
183 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  62.5 
 
 
183 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  43.4 
 
 
327 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  45.54 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  40.77 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  45.23 
 
 
287 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  43.73 
 
 
323 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  44.87 
 
 
328 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  44.52 
 
 
281 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  41.75 
 
 
281 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  42.81 
 
 
314 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  41.4 
 
 
281 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  38.22 
 
 
318 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  40.5 
 
 
325 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  36.15 
 
 
295 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  35.94 
 
 
338 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  36.69 
 
 
338 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  32.82 
 
 
338 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  70.73 
 
 
131 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  70.73 
 
 
131 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  37.14 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  37.76 
 
 
533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  36.3 
 
 
351 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  38.85 
 
 
334 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  34.12 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.25 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.27 
 
 
545 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  42.29 
 
 
247 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  32.9 
 
 
340 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  60 
 
 
197 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.63 
 
 
307 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.17 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  35.74 
 
 
340 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  35.91 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.69 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  35.19 
 
 
353 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  27.67 
 
 
398 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.85 
 
 
334 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  36.41 
 
 
477 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  32.75 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  30.57 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  30.27 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.77 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.52 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.52 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.87 
 
 
581 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  29.92 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.18 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  32.35 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.2 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>