193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3069 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
406 aa  833    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  58.79 
 
 
407 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  57.73 
 
 
415 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  45.76 
 
 
371 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  41.45 
 
 
350 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  44.38 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  43.8 
 
 
312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  41.26 
 
 
316 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  42.69 
 
 
322 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  42.15 
 
 
332 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  42.21 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  41.16 
 
 
316 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  41.16 
 
 
313 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  41.16 
 
 
313 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  41.16 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  41.16 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  40.57 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  40.58 
 
 
313 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  41.67 
 
 
315 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  40.58 
 
 
312 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  40.23 
 
 
324 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  42.81 
 
 
304 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  37.87 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.7 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  38.66 
 
 
353 aa  219  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  41.02 
 
 
304 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  38.99 
 
 
308 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  39.82 
 
 
304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  37.87 
 
 
363 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  39.82 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  39.46 
 
 
303 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  38.64 
 
 
366 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  37.43 
 
 
303 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.58 
 
 
310 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  38.28 
 
 
303 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  38.1 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  37.36 
 
 
343 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  36.99 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  38.99 
 
 
302 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  38.02 
 
 
299 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  39.16 
 
 
307 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  39.46 
 
 
304 aa  192  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  38.44 
 
 
307 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  35.33 
 
 
296 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  35.52 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  34.83 
 
 
328 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  34.3 
 
 
323 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.9 
 
 
300 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  32.02 
 
 
338 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  35.96 
 
 
302 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  35.99 
 
 
281 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  31.72 
 
 
338 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  35.76 
 
 
286 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.03 
 
 
533 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  35.96 
 
 
287 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  36.71 
 
 
281 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  34.56 
 
 
281 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  32.23 
 
 
304 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  33.04 
 
 
325 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  33.05 
 
 
318 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  32.95 
 
 
340 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  31.07 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  31.22 
 
 
327 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  32.46 
 
 
310 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  31.41 
 
 
314 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  29.59 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  31.61 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  29.32 
 
 
342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  29 
 
 
338 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  39.01 
 
 
183 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  39.01 
 
 
183 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  32.33 
 
 
545 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.94 
 
 
334 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  35.25 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  47.52 
 
 
197 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  44.17 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  44.17 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  27.67 
 
 
340 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  27.13 
 
 
398 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  27.01 
 
 
340 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.67 
 
 
306 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.84 
 
 
307 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.7 
 
 
302 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  34.42 
 
 
353 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.84 
 
 
334 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  25.92 
 
 
339 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  31.25 
 
 
477 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.42 
 
 
581 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.32 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.19 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.19 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.56 
 
 
309 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  38.78 
 
 
291 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.68 
 
 
306 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.91 
 
 
293 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.81 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.16 
 
 
307 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.42 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  28.81 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  29.3 
 
 
280 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>