223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3342 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  100 
 
 		 310 aa  634    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  50 
 
 		 304 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  49.35 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  49.51 
 
 		 303 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  49.01 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  48.55 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  47.59 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  50.47 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  45.13 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  47.56 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  46.02 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  44.74 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  44.76 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  45.95 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  45.9 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.92 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  46.25 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  46.08 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  44.41 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  45.74 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  44.73 
 
 		 316 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  43.24 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  47.12 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  44.76 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  42.95 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  44.66 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  43.63 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  44.09 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  43.91 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  42.9 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  43.91 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  43.91 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  43.91 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  43.91 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  44.52 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  43.87 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  41.23 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  37.58 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  37.25 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  44.03 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  43.58 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  45.33 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  40.51 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  40.19 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  37.54 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  39.05 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  36.33 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  39.93 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  39.13 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  39.5 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  38.75 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  36.76 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  39.6 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  36.72 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  38.93 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  37.54 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  36.81 
 
 		 366 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.8 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.73 
 
 		 407 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  35.01 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  41.53 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.89 
 
 		 340 aa  172  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  34.47 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  35.5 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  36.25 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  34.35 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  35.88 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  31.97 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.92 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  36.16 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  37.66 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  27.88 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  30.18 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.46 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  44.21 
 
 		 183 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  44.21 
 
 		 183 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  31.72 
 
 		 545 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  64.13 
 
 		 123 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  28.53 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.8 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.39 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  26.7 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  34.62 
 
 		 477 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.99 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.17 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  41.67 
 
 		 131 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  41.67 
 
 		 131 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04004  lactonohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08990)  31.49 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162257  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.35 
 
 		 581 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3124  hypothetical protein  42.57 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.23 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  28.73 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  30.14 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.79 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.07 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.82 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.15 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>