180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2519 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  100 
 
 
545 aa  1116    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  44.76 
 
 
351 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  42.55 
 
 
340 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  45.76 
 
 
287 aa  243  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  45.42 
 
 
281 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  42.36 
 
 
318 aa  233  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  40.72 
 
 
342 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  37.78 
 
 
533 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  38 
 
 
350 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.67 
 
 
300 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  35.41 
 
 
339 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  37.41 
 
 
299 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  36.69 
 
 
303 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  36.01 
 
 
296 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  36.48 
 
 
340 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  35.38 
 
 
357 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  35.27 
 
 
315 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  35.74 
 
 
366 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  36.73 
 
 
302 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  37.04 
 
 
334 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  34.19 
 
 
340 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  35.2 
 
 
363 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  35.69 
 
 
316 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  35.18 
 
 
324 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  37.3 
 
 
306 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  35.39 
 
 
308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  34.23 
 
 
352 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  36.01 
 
 
307 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  35.96 
 
 
322 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  35.64 
 
 
286 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  34.09 
 
 
308 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  38.29 
 
 
304 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  35.27 
 
 
316 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  35.2 
 
 
372 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  36.19 
 
 
332 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  33.75 
 
 
304 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  34.32 
 
 
303 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  33.33 
 
 
302 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  33.77 
 
 
304 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  33.66 
 
 
312 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  33.78 
 
 
316 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  36.24 
 
 
303 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  33.78 
 
 
313 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  34.33 
 
 
313 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  32.56 
 
 
398 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  33.78 
 
 
313 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  34.33 
 
 
313 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  34.97 
 
 
307 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  35.11 
 
 
353 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  33.9 
 
 
312 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.29 
 
 
368 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  35.27 
 
 
281 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.15 
 
 
310 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  33.99 
 
 
313 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  33.55 
 
 
328 aa  153  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  35.27 
 
 
281 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  32.68 
 
 
323 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  33.12 
 
 
304 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  31.92 
 
 
362 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  33.55 
 
 
328 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  34.19 
 
 
338 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  33.67 
 
 
304 aa  146  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  33.87 
 
 
338 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  31.67 
 
 
314 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  33.44 
 
 
325 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  32.3 
 
 
338 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  35.02 
 
 
343 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  31.72 
 
 
310 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.87 
 
 
407 aa  133  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  31.45 
 
 
338 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.85 
 
 
334 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  30.03 
 
 
295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.01 
 
 
302 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.33 
 
 
406 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  29.43 
 
 
327 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.43 
 
 
306 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.85 
 
 
307 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.41 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  32.2 
 
 
247 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  30.86 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  31.77 
 
 
371 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25 
 
 
581 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.36 
 
 
313 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.36 
 
 
313 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.36 
 
 
313 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.64 
 
 
309 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.25 
 
 
298 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.25 
 
 
298 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  32.49 
 
 
477 aa  90.5  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.36 
 
 
318 aa  90.1  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.36 
 
 
318 aa  90.1  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.12 
 
 
579 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.94 
 
 
309 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  29.87 
 
 
323 aa  88.2  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 
307 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  31.49 
 
 
183 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  31.49 
 
 
183 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.23 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.61 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.22 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>