More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4803 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  100 
 
 		 533 aa  1094    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  45.96 
 
 		 281 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  45.96 
 
 		 287 aa  237  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  41.1 
 
 		 302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  41.72 
 
 		 303 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  43.9 
 
 		 296 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  39.86 
 
 		 303 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  40.75 
 
 		 303 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  39.26 
 
 		 304 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  39.8 
 
 		 304 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  39.8 
 
 		 306 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  37.78 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  40.07 
 
 		 304 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  38.61 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  40.97 
 
 		 304 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.34 
 
 		 310 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  37.13 
 
 		 351 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.83 
 
 		 300 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  41.58 
 
 		 334 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.54 
 
 		 407 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  40.68 
 
 		 304 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  39.59 
 
 		 308 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  38.82 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  38.23 
 
 		 308 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  40.71 
 
 		 307 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  40.78 
 
 		 332 aa  186  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  39.78 
 
 		 307 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  40.43 
 
 		 312 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  41.16 
 
 		 328 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  40.07 
 
 		 323 aa  180  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  37.29 
 
 		 322 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  40.36 
 
 		 302 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  37.41 
 
 		 316 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  39.86 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  37.41 
 
 		 313 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  37.41 
 
 		 313 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  37.41 
 
 		 313 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  37.93 
 
 		 312 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  37.41 
 
 		 313 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  37.76 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  34.88 
 
 		 318 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  36.21 
 
 		 316 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  37.8 
 
 		 313 aa  173  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  37.24 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  37.28 
 
 		 314 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  35.44 
 
 		 324 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.67 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  36.24 
 
 		 357 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.54 
 
 		 340 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  35.5 
 
 		 310 aa  167  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  37.99 
 
 		 327 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  36.33 
 
 		 353 aa  163  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  34.13 
 
 		 363 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  38.64 
 
 		 338 aa  163  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.03 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 		 415 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  35.59 
 
 		 315 aa  156  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  30.06 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  33.66 
 
 		 338 aa  154  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  32.34 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  33.1 
 
 		 286 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  33.45 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  34.66 
 
 		 281 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  33.8 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  32.56 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  35.62 
 
 		 339 aa  147  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  33.58 
 
 		 281 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.25 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  32.36 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  31.68 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.58 
 
 		 368 aa  140  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  33.12 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  37.5 
 
 		 247 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  29.35 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  30.61 
 
 		 295 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.38 
 
 		 302 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  31.17 
 
 		 340 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.47 
 
 		 306 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.08 
 
 		 334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  37.1 
 
 		 205 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 204 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  34.72 
 
 		 353 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  36.11 
 
 		 183 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  36.11 
 
 		 183 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 213 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 201 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 194 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 213 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 213 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 217 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.93 
 
 		 581 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.5 
 
 		 195 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.04 
 
 		 296 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.77 
 
 		 293 aa  90.9  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.37 
 
 		 303 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.14 
 
 		 214 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 210 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.19 
 
 		 197 aa  86.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.36 
 
 		 301 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>