More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1993 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  53.06 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  54.3 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  57.53 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  51.89 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 190 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  36.57 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  37.4 
 
 		 174 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.77 
 
 		 533 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.59 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  27.46 
 
 		 389 aa  75.1  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.9 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  36.99 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.22 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.1 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.9 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  28.95 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.04 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  25.93 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.21 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.91 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.21 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  29.73 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  27.4 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  26.94 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  26.94 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.23 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  29.73 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.89 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  26.48 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>