More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0259 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  47.69 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  46.24 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  50.85 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  52.87 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  47.89 
 
 		 189 aa  164  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  44.2 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  52.1 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  41.01 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  41.32 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  39.52 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  41.86 
 
 		 243 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  41.32 
 
 		 211 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  40.12 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  40.24 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  38.97 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.5 
 
 		 533 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  30.73 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  30.88 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  30.39 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  30.89 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  35.2 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.84 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.84 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.84 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.84 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.84 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  29.17 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  31.05 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  28.49 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  31.47 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  31.47 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  30.93 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  30.77 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  30.93 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  30.93 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  28.65 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  30.89 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.98 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  25.47 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  41.57 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  25.4 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>