More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1876 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  54.3 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  54.84 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  52.66 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  48.98 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  36.27 
 
 		 533 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  41.43 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  35.98 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  35.23 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  33.74 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.89 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  29.74 
 
 		 214 aa  88.2  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.7 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.71 
 
 		 244 aa  77.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  31.1 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.9 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  28.75 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  39.26 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  32.54 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  32.08 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  32.08 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  32.08 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  32.08 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  33.12 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  32.08 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  38.65 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.87 
 
 		 389 aa  71.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  34.47 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  37.4 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.19 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  31.67 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.39 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  32.68 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  37.61 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  37.61 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  39.45 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  37.61 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 		 239 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.99 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  32.4 
 
 		 377 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>