More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6622 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  56.99 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  52.58 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  50.96 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  51.05 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  50.26 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  53.16 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  51.56 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  49.21 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  49.21 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  49.21 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  48.15 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  51.04 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  45.23 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  43.68 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  38.58 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  40.32 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 231 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  47.7 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  38.73 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  39.3 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  34.03 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  37 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.66 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 189 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 193 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  35.27 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  38.56 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.5 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  39.47 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  41.96 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  32.3 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  33.68 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  27.09 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  27.09 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.81 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.99 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.99 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.99 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  28.99 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.99 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  32.47 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>