More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1908 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  43.26 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 		 179 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  40.56 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  39.77 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  39.77 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  39.77 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  39.77 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  39.77 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  39.77 
 
 		 179 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  39.2 
 
 		 179 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  39.77 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  38.41 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  34.18 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  26.54 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  28 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  29.61 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  28.32 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  36.56 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  28.57 
 
 		 287 aa  62  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  24.29 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  36.96 
 
 		 102 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  36.56 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  36.56 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  25.53 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  27 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  36.96 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  29.1 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  29.1 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  29.1 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  29.1 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.54 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  29.1 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  27.46 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  25.96 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  24.21 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  26.63 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  26.47 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  23.7 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  26.47 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  26.47 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  22.9 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>