More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4294 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  66.02 
 
 		 216 aa  278  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 224 aa  278  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  62.09 
 
 		 211 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  64.71 
 
 		 231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  65.31 
 
 		 208 aa  269  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  62 
 
 		 215 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  62 
 
 		 215 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  62 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  63.54 
 
 		 223 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  43.15 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  43.72 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  43.94 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  44.67 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  44.67 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  44.67 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  41.29 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  38.42 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  44.28 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  41.87 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  39.41 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  43.2 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  38 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  47.78 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  38.68 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  39.9 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  31.84 
 
 		 247 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  33.52 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.07 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  28.95 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  38.83 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  28.95 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.12 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.71 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  27.89 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  27.89 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.41 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  28.78 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  27.89 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.78 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.7 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  24.42 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  42.5 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>