More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3789 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  79.41 
 
 		 216 aa  332  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  80 
 
 		 211 aa  330  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  74.26 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  73.66 
 
 		 224 aa  302  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  72.41 
 
 		 215 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  72.41 
 
 		 215 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  72.41 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  73.23 
 
 		 223 aa  288  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  65.31 
 
 		 213 aa  269  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  45.79 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  43.56 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  44.85 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  43.16 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  43.94 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  46.15 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  41.75 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  41.92 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  38.58 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  47.03 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  41.34 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  36.74 
 
 		 227 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  31.4 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 251 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.15 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  30.1 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  34.97 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  35.15 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  24.57 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.29 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  45.83 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  47.22 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  47.22 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.9 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.86 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.78 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  42.17 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.88 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  32.26 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  36.28 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.87 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  29.3 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>