More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2511 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 216 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  79.41 
 
 		 208 aa  332  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  79.9 
 
 		 231 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  77.72 
 
 		 224 aa  324  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  78.46 
 
 		 211 aa  322  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  69.95 
 
 		 215 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  69.95 
 
 		 215 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  69.95 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  66.18 
 
 		 213 aa  280  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  71.57 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  43.78 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  42.23 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  43.46 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  44 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  44.44 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  44.06 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  45.77 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  39.23 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  41.58 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  38.05 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  38.66 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  37.67 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  39.3 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  32.58 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  34.02 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  36.94 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  32.24 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  35.42 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  32.52 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  32.73 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.63 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  28.04 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  28.04 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30.61 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.69 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  30 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  28 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  47.37 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>