275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4354 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  70.39 
 
 		 236 aa  343  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  40.85 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  40.19 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  38.32 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  38.28 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  35.02 
 
 		 218 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  36.18 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  39.15 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  39.15 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  39.15 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  34.72 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  38.19 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 209 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  39.18 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 216 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 224 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  31.3 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  30.32 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  30.58 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  25.71 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  29.85 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  25.58 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.85 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  28.77 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  32.74 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.01 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  29.01 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.09 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  24.68 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  27.7 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.7 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.9 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  24.88 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.23 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  24.26 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  24.88 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  24.88 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  24.88 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  29.75 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  25.35 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  24.88 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  22.82 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  24.56 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  24.77 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  22.71 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  21.95 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>