More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4611 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  100 
 
 
186 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  41.99 
 
 
189 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  41.4 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  43.26 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  37.16 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  37.16 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  40.24 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  43.5 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  35.56 
 
 
197 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  36.42 
 
 
198 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
197 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  36 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  33.15 
 
 
227 aa  80.9  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  37.71 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  36 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.79 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  32.57 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  32.57 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  32.57 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  32.57 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  32.57 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  32.57 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  32.12 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  32 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  33.33 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  30.81 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  28.24 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.84 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
266 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  32 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  42.68 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  32 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  34.1 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.78 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  36.75 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28.64 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  34.51 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.82 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  41.53 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>