168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3668 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  82.67 
 
 
217 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  82.67 
 
 
217 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  82.67 
 
 
217 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  79.52 
 
 
211 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  78.57 
 
 
211 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  81.35 
 
 
211 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  81.82 
 
 
189 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  82.16 
 
 
212 aa  314  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  81.28 
 
 
189 aa  311  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  78.38 
 
 
223 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  77.3 
 
 
189 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  77.3 
 
 
189 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  77.54 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  41.86 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  39.23 
 
 
197 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 
197 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 
189 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  41.52 
 
 
183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 
189 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 
189 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 
187 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  37.1 
 
 
198 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  41.35 
 
 
135 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
174 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  30 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  29.46 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 
218 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 
214 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
204 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  30.77 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 
187 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  27.15 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  23.64 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  29.73 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  27.22 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  28.48 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  26.42 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  30.54 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
216 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  52  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  23.56 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  23.56 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  34.02 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  25.63 
 
 
533 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
196 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  25.91 
 
 
188 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  31.4 
 
 
221 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  25.88 
 
 
201 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.27 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.27 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
187 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  27.81 
 
 
218 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  38.16 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  26.16 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  24.02 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  26.16 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  25.56 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  27.81 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 
209 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  25.9 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  29.57 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 
234 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 
190 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  26.16 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 
215 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>