203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5339 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  80.56 
 
 		 211 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  82.67 
 
 		 243 aa  339  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  83.96 
 
 		 211 aa  331  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  82.89 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  79.79 
 
 		 189 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  80.32 
 
 		 189 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  78.26 
 
 		 189 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  78.26 
 
 		 189 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  81.82 
 
 		 212 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  76.5 
 
 		 223 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  70.71 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  40.68 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  39.04 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  35.08 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  40.77 
 
 		 135 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 		 174 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  28.09 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  28.42 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  31.2 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.29 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  36.36 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  28.11 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  28.11 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  24.7 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  28.11 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  29.19 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  28.11 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  28.11 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  28.99 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.5 
 
 		 533 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  33.55 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  26.26 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  39.39 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.71 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  35.34 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.57 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.57 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  27.39 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  27.81 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  23.04 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  23.04 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  26.51 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  24.58 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.73 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.74 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  26.51 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.57 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.57 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>