More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0172 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
185 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
185 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  45.95 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  40.54 
 
 
188 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  40.54 
 
 
188 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  40.54 
 
 
188 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  40.54 
 
 
188 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  40.54 
 
 
188 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  38.54 
 
 
199 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  39.46 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  40.74 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  40.74 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  40.74 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  40.74 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  40.74 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  37.5 
 
 
199 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  40.74 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  40.21 
 
 
188 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  39.25 
 
 
190 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  38.34 
 
 
199 aa  131  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  37.57 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  37.57 
 
 
200 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  38.12 
 
 
195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 
204 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  37.63 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
187 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
187 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
187 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
187 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
187 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
189 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
191 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 
187 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
188 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
166 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 
218 aa  88.2  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  37.14 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  45.78 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.18 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
246 aa  74.7  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.87 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
289 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  26.34 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.49 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  31.51 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  25.93 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  35.51 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  26.13 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  27 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>