More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1678 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
166 aa  333  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  41.34 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  45.4 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  41.01 
 
 
195 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  41.01 
 
 
200 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  41.01 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  40.44 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  40.64 
 
 
199 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  37.64 
 
 
188 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  36.46 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  44.71 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  36.07 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  36.31 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 
198 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  36.57 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 
185 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 
187 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
185 aa  99  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
185 aa  99  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  38.6 
 
 
187 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
187 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  36.47 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
191 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
187 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  31.32 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.12 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.78 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  36.27 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  28.26 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  30.83 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.26 
 
 
359 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
213 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  32.41 
 
 
210 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.01 
 
 
176 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
196 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  26.81 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  26.81 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  26.81 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
177 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  27.62 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
342 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 
226 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 
205 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  35.71 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
201 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  35.07 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  26.81 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  25.32 
 
 
188 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 
204 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  33.1 
 
 
193 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30.14 
 
 
193 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 
247 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
195 aa  58.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  38.32 
 
 
187 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>