More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1847 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  56.47 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  56.47 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  55.88 
 
 		 176 aa  187  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  49.04 
 
 		 173 aa  163  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  48.24 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  42.05 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  42.41 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  41.29 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  38.07 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  38.07 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  38.07 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  40.51 
 
 		 359 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  43.29 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 237 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  39.87 
 
 		 359 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  40.65 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  41.1 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  40.12 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  40.49 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  40.49 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  40.24 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  41.77 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  40.49 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  36.6 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  38.67 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  35.17 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  37.34 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  38.81 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  38.81 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  37.34 
 
 		 180 aa  97.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  38.06 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  39.02 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  34.42 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  37.4 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  37.58 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  32.64 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 174 aa  84.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  34.55 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  38.41 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  38.85 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  30.82 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  28.65 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  28.12 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  28.75 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  28.07 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  26.9 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  28.07 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  28.47 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>