More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5815 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  51.89 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  49.19 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  47.83 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  45.56 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  48.57 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  44.2 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  44.57 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  44.57 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  41.76 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  39.57 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  34.1 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 243 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  34.83 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  34.83 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  35.39 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 211 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  32.24 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  32.07 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  32.14 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  28.8 
 
 		 291 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  29.82 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  28.49 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.69 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>