More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3307 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  55.37 
 
 		 189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  53.11 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  48.57 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  53.33 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  52.1 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  48.32 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  43.5 
 
 		 186 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  42.01 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 211 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 217 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 217 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 217 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 211 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  38.41 
 
 		 210 aa  94.4  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 243 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 212 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  33.72 
 
 		 223 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  42.06 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  34.57 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  34.57 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  34.57 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  34.57 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  34.57 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  46.24 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  30.07 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  35.04 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  41.96 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  34.46 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  35.46 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  33.78 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  33.78 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  33.78 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  33.78 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  33.78 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  33.33 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  33.78 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  35 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  34.06 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  37.31 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  37.31 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  37.31 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  32.43 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  37.31 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  37.31 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  37.31 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  37.31 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  36.64 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  33.57 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  36.64 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  33.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  34.33 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  36.43 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  32.35 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.33 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  36.43 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  33.58 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  38.39 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.56 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.64 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.4 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>