More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1705 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  97.49 
 
 
239 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  94.56 
 
 
239 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  83.56 
 
 
233 aa  380  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  77.88 
 
 
234 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  74.89 
 
 
227 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  77.78 
 
 
231 aa  364  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  75.33 
 
 
230 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  74.01 
 
 
230 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  77.13 
 
 
227 aa  358  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  72.77 
 
 
234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  71 
 
 
234 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  74.55 
 
 
228 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  76.26 
 
 
228 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  74.21 
 
 
233 aa  352  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  73.66 
 
 
232 aa  347  8e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  74.21 
 
 
241 aa  333  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  68.64 
 
 
247 aa  329  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  64.13 
 
 
230 aa  320  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  56.5 
 
 
389 aa  265  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  50.91 
 
 
240 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  55.91 
 
 
226 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  55.45 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  52.21 
 
 
236 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  53.6 
 
 
228 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  55 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  54.71 
 
 
240 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  49.07 
 
 
227 aa  211  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  47.93 
 
 
231 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  53.05 
 
 
225 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  53.42 
 
 
222 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  53.42 
 
 
222 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  53.42 
 
 
222 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  53.49 
 
 
223 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  53.57 
 
 
233 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  47.06 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  51.22 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  49.08 
 
 
231 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  49.06 
 
 
231 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  48.66 
 
 
230 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  44.8 
 
 
222 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 
230 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 
230 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  48.15 
 
 
223 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  51.64 
 
 
229 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  46.85 
 
 
232 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  43.44 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  44.09 
 
 
236 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 
281 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  37.61 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  35.58 
 
 
274 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.33 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.46 
 
 
231 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
231 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.99 
 
 
230 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
231 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.99 
 
 
230 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.99 
 
 
231 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.2 
 
 
231 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 
248 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.25 
 
 
244 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.64 
 
 
231 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 
248 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.36 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.46 
 
 
233 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 
224 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 
205 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.47 
 
 
246 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
199 aa  92  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
252 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.43 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30.23 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
204 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.48 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
191 aa  85.9  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
201 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
224 aa  85.1  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 
235 aa  82  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>