More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4714 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  45.19 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  84.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.99 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  47.56 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  38.18 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  47.56 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  35.33 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  46.25 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  41.53 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  44.58 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  40.59 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  30.43 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  37.61 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  35.96 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  37.61 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  38.05 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  37.61 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  38.05 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  31.85 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.85 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  31.85 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  38.68 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  34.69 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  29.68 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  42.5 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  37.86 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  42.68 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  34.48 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  42.86 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  43.42 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  38.27 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  35.35 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  30.36 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  30.2 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  45.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30.41 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  30.2 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  41.43 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.57 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  41.43 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  41.43 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  36.75 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  29.46 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  34.09 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.46 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  38.57 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>