More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1371 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  96.96 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  78.32 
 
 		 227 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  76.99 
 
 		 231 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  78.32 
 
 		 234 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  76.21 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  75.33 
 
 		 239 aa  363  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  75.77 
 
 		 239 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  76 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  77.48 
 
 		 228 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  76.75 
 
 		 228 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  74.89 
 
 		 233 aa  356  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  73.01 
 
 		 232 aa  356  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  75.11 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  74.67 
 
 		 233 aa  354  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  70.67 
 
 		 227 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  65.49 
 
 		 230 aa  323  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  69.64 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  67.27 
 
 		 247 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  52.23 
 
 		 389 aa  251  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  50.44 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  49.14 
 
 		 231 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  53.1 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  53.78 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  51.54 
 
 		 236 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  52.65 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  52.21 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  52.66 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  51.13 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  52.81 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  52.81 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  52.81 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  47.66 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  47.77 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  47.56 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  46.67 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  48.68 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  48.68 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  47.32 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 		 222 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  43.11 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  46.15 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  44.25 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  42.61 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  41.89 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  47.69 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  35.71 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  34.45 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  34.26 
 
 		 248 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.6 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.63 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  34.31 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.18 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  34.31 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.52 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.18 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.74 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  33.02 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  34.48 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.58 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  33.62 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 205 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.91 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  28.63 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.07 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>