More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5238 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  91.34 
 
 		 231 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  71.9 
 
 		 223 aa  311  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  71.5 
 
 		 223 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  66.06 
 
 		 225 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  63.3 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  65.89 
 
 		 225 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  61.67 
 
 		 236 aa  285  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  56.72 
 
 		 281 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  68.72 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  61.79 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  66.2 
 
 		 226 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  61.86 
 
 		 222 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  65.73 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  61.75 
 
 		 222 aa  268  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  61.9 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  58.04 
 
 		 236 aa  267  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  65.73 
 
 		 226 aa  266  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  60.19 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  58.72 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  60.93 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  60.55 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  60.55 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  59.55 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  55.45 
 
 		 222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  55.45 
 
 		 222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  55.45 
 
 		 222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  50.23 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  51.94 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  49.08 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  48.18 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  50 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  45.54 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  46.41 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  44.93 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  49.06 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  49.06 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  46.02 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  48.11 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  47.51 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  49.27 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  48.33 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  44.25 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  44.09 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  43.95 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  45.16 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  47.14 
 
 		 389 aa  184  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  39.53 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.24 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.68 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.68 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.68 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.18 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.65 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.68 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.54 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.19 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.92 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.34 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  34.45 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  34.59 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.6 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.62 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.73 
 
 		 176 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.73 
 
 		 176 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.73 
 
 		 176 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 359 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>