More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0992 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  57.84 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  35.55 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  35.35 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  36.5 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.27 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.45 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.72 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  29.36 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.31 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.31 
 
 		 389 aa  92.8  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.91 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  28.27 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.27 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  34.46 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  34.55 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  27.75 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  27.75 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  27.75 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  30 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  27.75 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.85 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.8 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.87 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.18 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  26.84 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.85 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  31.96 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  32.81 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  32.81 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  30.12 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  30.12 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  30.12 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  30.65 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>