More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6446 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  75.23 
 
 		 240 aa  332  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  70.91 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  72.2 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  72.2 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  69.09 
 
 		 230 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  67.45 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  65.73 
 
 		 228 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  68.66 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  68.2 
 
 		 226 aa  284  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  67.76 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  66.36 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  58.04 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  60.55 
 
 		 223 aa  265  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  58.6 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  59.35 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  64.19 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  64.19 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  64.19 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  56.74 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  56.16 
 
 		 222 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  62.39 
 
 		 229 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  55.66 
 
 		 222 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  56.82 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  54.55 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  55.25 
 
 		 225 aa  247  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  57.08 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  53.95 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  53.57 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  55.76 
 
 		 234 aa  224  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  52.19 
 
 		 239 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  51.77 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  51.54 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  53.81 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  52.21 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  51.1 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  53.46 
 
 		 228 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  51.77 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  51.33 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  51.08 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  50.45 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  51.63 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  53.7 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  47.35 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  47.47 
 
 		 389 aa  202  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  45.65 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  48.08 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  34.8 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.91 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.91 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.91 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.91 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.91 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  38.3 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.3 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.49 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.52 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.72 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  33.48 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 329 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.49 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 204 aa  89  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.2 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.76 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  33.8 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.83 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  35.27 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  37.5 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>