More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2027 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  75.78 
 
 		 230 aa  345  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  70.91 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  74.34 
 
 		 230 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  74.34 
 
 		 230 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  70.42 
 
 		 228 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  70.91 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  63.3 
 
 		 231 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  64.19 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  72.9 
 
 		 226 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  72.43 
 
 		 226 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  71.5 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  65.88 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  67.89 
 
 		 233 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  61.29 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  60.19 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  67.44 
 
 		 222 aa  271  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  67.44 
 
 		 222 aa  271  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  67.44 
 
 		 222 aa  271  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  60.63 
 
 		 223 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  61.35 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  59.91 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  57.97 
 
 		 222 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  57.97 
 
 		 222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  57.55 
 
 		 232 aa  241  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  60.93 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  53 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  52.02 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  52.44 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  46.45 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  53.12 
 
 		 233 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  50.45 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  50.69 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  50.67 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  51.56 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  49.78 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  47.75 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  50.23 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  47.62 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  48.42 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  48.03 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  47.96 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  44.14 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  46.82 
 
 		 389 aa  195  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  44.17 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  40.71 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.48 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  35.53 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.04 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.04 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.04 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.04 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.61 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  32.44 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.39 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.77 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.49 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.9 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.9 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 201 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.82 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.8 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>