More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0275 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  73.49 
 
 		 231 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  71.9 
 
 		 231 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  72.43 
 
 		 229 aa  299  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  66.82 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  65.37 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  65.85 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  63.47 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  63.13 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  65.12 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  64.19 
 
 		 236 aa  275  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  61.29 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  59.35 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  53.33 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  64.35 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  63.89 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  60.28 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  58.8 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  62.96 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  60.95 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  60.95 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  59.82 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  61.46 
 
 		 223 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  60.75 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  58.53 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  58.53 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  58.53 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  52.21 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  51.16 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  53 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  52.36 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  50.46 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 230 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  49.77 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  46.58 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  50 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  47.95 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  49.33 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  47.44 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  47.87 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  48.83 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  46.51 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  48.15 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  48.15 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  48.15 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  46.86 
 
 		 389 aa  181  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  41.74 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.02 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.09 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.09 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.09 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.09 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  29.63 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.99 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 248 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.48 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  30.45 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  29.38 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  34.32 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.82 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.63 
 
 		 359 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.66 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.13 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  30 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>