More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1373 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  91.34 
 
 		 231 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  73.49 
 
 		 223 aa  317  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  68.66 
 
 		 223 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  67.44 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  67.45 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  66.36 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  64.19 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  68.72 
 
 		 229 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  62.26 
 
 		 232 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  68.6 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  62.62 
 
 		 222 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  68.12 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  62.21 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  63.77 
 
 		 223 aa  267  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  65.73 
 
 		 226 aa  267  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  60.28 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  58.6 
 
 		 236 aa  264  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  58.72 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  60.18 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  61.21 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  62.38 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  62.38 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  52.04 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  57.82 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  57.82 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  57.82 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  52.49 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  52 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  51.42 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  50.22 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  47.85 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  50 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  46.43 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  48.65 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  49.77 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  50.46 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  49.08 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  51.2 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  49.08 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  49.08 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  46.36 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  52.08 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  46.15 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  44.49 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  45.33 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  46.23 
 
 		 389 aa  184  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  42.36 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  38.6 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.09 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.34 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  27.75 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  27.75 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  27.75 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  27.75 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.43 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.45 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.23 
 
 		 274 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.14 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  32.51 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  28.94 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.05 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 266 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.4 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.4 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  29.96 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  26.73 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  30 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  29.03 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>