More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2058 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  73.11 
 
 		 217 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  73.11 
 
 		 217 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  71.64 
 
 		 220 aa  289  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  48.11 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  39.71 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  40.49 
 
 		 247 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  37.44 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.84 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 230 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.53 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  32.35 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.78 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  28.08 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  32.49 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.43 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.64 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.51 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.56 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.24 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  27.88 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  30.88 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.44 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  28.51 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  28.44 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.97 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.97 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.97 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  27.35 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  27.35 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.5 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  33.16 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.18 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.04 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.52 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  40.23 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  27.68 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  23.5 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  23.5 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  39.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  39.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  39.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  39.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>