More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3479 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  36.79 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  35.5 
 
 		 188 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.89 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  34.32 
 
 		 191 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  35.79 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5107  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0633461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  36.09 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  34.07 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.33 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  35.71 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  35.75 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  32.93 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  34.64 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  30.72 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.9 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  34.55 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  35.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  34.03 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  35.83 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  37.42 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  33.93 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.74 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.74 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.22 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  31.52 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.22 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  32.16 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30.52 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  32.16 
 
 		 290 aa  72  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 228 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.33 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  33.14 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.73 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.33 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.33 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  48.65 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>