More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4231 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  70.69 
 
 
180 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  66.09 
 
 
180 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  66.09 
 
 
180 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  66.09 
 
 
180 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  58.62 
 
 
181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  58.62 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  58.05 
 
 
181 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  52.63 
 
 
172 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  35.8 
 
 
176 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  35.8 
 
 
176 aa  120  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  34.88 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  43.31 
 
 
177 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 
174 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  35.26 
 
 
359 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  34.88 
 
 
176 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  34.88 
 
 
176 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  34.88 
 
 
176 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  34.3 
 
 
359 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  40.94 
 
 
173 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  36.84 
 
 
176 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  33.33 
 
 
168 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 
186 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  36.48 
 
 
173 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 
186 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  41.77 
 
 
177 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 
175 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  41.94 
 
 
183 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  38.33 
 
 
237 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  36.75 
 
 
186 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  36.14 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  38.33 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  41.29 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  41.29 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  41.29 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  40.51 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  41.29 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  41.29 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 
186 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  39.24 
 
 
177 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  36.75 
 
 
186 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  35.54 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  36.14 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  35.54 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  38.65 
 
 
183 aa  94.4  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  33.94 
 
 
161 aa  94  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  33.92 
 
 
196 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
183 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  39.87 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  39.72 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  36.73 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  39.72 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  28.66 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  34.72 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  26.22 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  33.88 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  26.22 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  26.22 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  26.22 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  35.4 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.29 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 
248 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
240 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  34.16 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>