226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2915 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5107  isochorismatase hydrolase  69.16 
 
 
226 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0633461 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  25.23 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  33.11 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  29.47 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 
189 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
215 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  33.04 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  26.74 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  32.99 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 
289 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.28 
 
 
189 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  30.48 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  25.5 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  31 
 
 
96 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  26.8 
 
 
181 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  22.98 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 
186 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  24.31 
 
 
172 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  33.96 
 
 
207 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  33.96 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  33.96 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  33.96 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  33.72 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  28 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  24.18 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  26.09 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  30.91 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  31.43 
 
 
185 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  22.36 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  22.36 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  24.58 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  21.12 
 
 
181 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  28.81 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  21.78 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  20.5 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  20.5 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 
199 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  20.5 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  21.12 
 
 
187 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  30.32 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 
199 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  26.04 
 
 
184 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 
199 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>