More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2658 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  98.62 
 
 		 240 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  86.45 
 
 		 248 aa  363  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  87.86 
 
 		 221 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  87.86 
 
 		 221 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  87.38 
 
 		 221 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  62.62 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  64.08 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  62.25 
 
 		 209 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 219 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 219 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  55.02 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  59.72 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  54.55 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  53.65 
 
 		 193 aa  215  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  56.57 
 
 		 201 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  51.11 
 
 		 211 aa  187  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  51.37 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  49.45 
 
 		 185 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  48.98 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  47.22 
 
 		 342 aa  162  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  37.85 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  37.02 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 		 172 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  32.4 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  45.53 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  35.36 
 
 		 182 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 		 182 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  35.81 
 
 		 177 aa  85.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.84 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.34 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  28.96 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  34.32 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  33.53 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.69 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.69 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  30.05 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  30.05 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.05 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  28.96 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.96 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  28.96 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.64 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  30.6 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>