More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3382 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  96.12 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  95.63 
 
 		 207 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  62.32 
 
 		 207 aa  293  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  67.63 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  57.49 
 
 		 251 aa  240  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  49.51 
 
 		 295 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  49.51 
 
 		 295 aa  231  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  49.51 
 
 		 295 aa  231  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  49.28 
 
 		 295 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  49.28 
 
 		 295 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  49.28 
 
 		 295 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  50.72 
 
 		 297 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  49.03 
 
 		 297 aa  228  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  49.27 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  52.97 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  49.27 
 
 		 297 aa  226  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  49.27 
 
 		 297 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  52.97 
 
 		 290 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  50.73 
 
 		 284 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  50.24 
 
 		 291 aa  220  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  53.08 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  49.51 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  46.86 
 
 		 287 aa  214  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  50.72 
 
 		 327 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  51.92 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  47.57 
 
 		 284 aa  207  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  46.83 
 
 		 299 aa  205  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  47.8 
 
 		 291 aa  205  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  47.09 
 
 		 294 aa  204  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  46.12 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  50.73 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  46.63 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  45.15 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  48.29 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  47.6 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  44.93 
 
 		 296 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  44.39 
 
 		 283 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  48.34 
 
 		 291 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  47.42 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  47.34 
 
 		 260 aa  181  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  47.06 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  45.32 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  47.83 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  43.35 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  42.58 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  46.38 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  46.57 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.45 
 
 		 319 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  39.01 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  26.74 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.43 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  21.43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  26.77 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2963  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  30.17 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>