More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2962 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  64.88 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  51.53 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  54.88 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  49.7 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 		 313 aa  100  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  38.3 
 
 		 316 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  41.1 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 		 223 aa  97.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 		 316 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  34.72 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 		 193 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.81 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  37.84 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 		 193 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  38.62 
 
 		 203 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  45.53 
 
 		 240 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  32.64 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 182 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 182 aa  87.8  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.94 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  32.64 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  45.53 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  32.64 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 		 342 aa  85.5  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  32.64 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 211 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  32.64 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 211 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 		 221 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 		 221 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  36.67 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.33 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.33 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.33 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  41.13 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  37.16 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  35.33 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  33.55 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  34.67 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  40.43 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  34.51 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.67 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  34 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  36.49 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  38.84 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  38.84 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  32.24 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  34.64 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  33.56 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.28 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.28 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>