More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0481 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  61.96 
 
 
184 aa  228  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  59.02 
 
 
194 aa  223  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  59.02 
 
 
194 aa  223  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  44.19 
 
 
209 aa  125  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  24.5 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
231 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  29.84 
 
 
297 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  35 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.77 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  30.77 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  29.61 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  32.37 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  32.37 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  32.37 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  29.28 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  28.96 
 
 
270 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.37 
 
 
359 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  31.67 
 
 
297 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  27.17 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  30.77 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  31.52 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  31.52 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.41 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  32.22 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  32.22 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  30.65 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  30.71 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  30.98 
 
 
297 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  31.11 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  31.49 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  31.49 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  31.49 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  27.72 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  37.23 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  30 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  25.64 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  26.92 
 
 
278 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
329 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  24.24 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  25.28 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.39 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  27.18 
 
 
216 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
236 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  30.11 
 
 
285 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  30.11 
 
 
285 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  30.11 
 
 
285 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  40.23 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  30.11 
 
 
285 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  30.11 
 
 
285 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  28.96 
 
 
284 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  30.11 
 
 
285 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>