More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2236 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  54.86 
 
 		 187 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  54.29 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  54.07 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  50.59 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  50.59 
 
 		 181 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  50.59 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  50.59 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  50.59 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  50 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  50 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  49.41 
 
 		 181 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  49.41 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  49.41 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  46.7 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  45.81 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 181 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  45.4 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  43.45 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  46.47 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  40.88 
 
 		 316 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  39.53 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  38.55 
 
 		 316 aa  134  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 		 207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  42.26 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  41.72 
 
 		 313 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  44.91 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  46.98 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  46.98 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  41.57 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  45.64 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  44.08 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  44.08 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  44.08 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  42.58 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  40.12 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  41.94 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  44.63 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  47.68 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  38.01 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  43.54 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  39.49 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  42.03 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.07 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  35.43 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  41.61 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  37.57 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  40.27 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  35.36 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.57 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  37.16 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  40.48 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  37.37 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 		 342 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  41.78 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  33.09 
 
 		 359 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  32.64 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 289 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 		 203 aa  88.2  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  40.79 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.83 
 
 		 176 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.83 
 
 		 176 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.83 
 
 		 176 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  43.79 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>