More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0813 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  81.91 
 
 		 199 aa  314  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  83.25 
 
 		 199 aa  298  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  83.25 
 
 		 199 aa  298  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  85.34 
 
 		 199 aa  283  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  60.96 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  57.22 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  66.83 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  60.51 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  60.51 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  60.51 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  61.62 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  57.89 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  60.62 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  51.35 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  46.94 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  50.8 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  43.24 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  43.78 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  45.79 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  39.79 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  41.36 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  45.41 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  45.99 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  40.84 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  43.01 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  39.58 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  39.79 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  42.02 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  42.56 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  49.39 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  50.62 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  42.02 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  43.11 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  42.94 
 
 		 181 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  36.79 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  47.43 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  40.36 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  36.79 
 
 		 231 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  39.78 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  35.43 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  35.26 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  35.09 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  44.64 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  34.29 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  35.06 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  35.06 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  35.06 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  35.09 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  35.47 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  35.47 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  39.18 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 289 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  37.23 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 313 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  32 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 316 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 		 342 aa  90.5  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  32.75 
 
 		 316 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  37.85 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  39.42 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.64 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.72 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>