More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4435 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  91.67 
 
 		 180 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  91.67 
 
 		 180 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  91.67 
 
 		 180 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  70.69 
 
 		 194 aa  248  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  55.56 
 
 		 172 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  39.41 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  43.2 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  39.16 
 
 		 359 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  39.41 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  39.41 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  39.41 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  38.01 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  38.24 
 
 		 359 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  36.81 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  41.32 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  37.42 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  45.16 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  40.13 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  37.71 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  40.61 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 228 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  42.58 
 
 		 237 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  38.99 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  42.58 
 
 		 237 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  42.58 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  42.58 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  42.58 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  42.58 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  42.58 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  36.31 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  36.31 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  35.12 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  36.31 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  36.31 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  36.31 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 		 173 aa  97.8  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  37.34 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  36.31 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  35.12 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  39.22 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  35.12 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  40.25 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  38.79 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 183 aa  90.9  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 		 342 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.46 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.46 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  37.23 
 
 		 207 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 231 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  32.3 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  35.03 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  40.41 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  33.72 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.37 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  34.29 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  38.58 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  38.41 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 240 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 217 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  25.88 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  34.66 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  39.13 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.89 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  39.26 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  25.3 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>